Procesando...Aunque Hibiki y el resto de la tripulación derrotaron una nave de combate enorme de la Tierra al final de la primera parte, descubrieron que 5 naves se dirigían a Mejeiru y Tarahk. También descubrieron que en dichos planetas es donde sus hogares se vieron forzados a la tradición del Karitori (la cosecha). El viaje a casa se acelera para poder informar de la crisis. En el trayecto encuentran a una chica llamada Misty, la cual les enseña costumbres de la Tierra anteriores al desastre que desencadenó la cosecha, además de encapricharse con Hibiki; haciéndole a Dita la vida imposible. Cuando lleguen al final de su viaje deberán combinar sus vehículos una vez más y obtener un Vandread más poderoso aún si es que quieren salvar su planeta
Akemitsu Akegami siempre escuchó de su padre que "nadie puede vivir solo"... pero él está decidido a hacerlo. Después de todo, su padre no estaba diciéndolo con las mejores intenciones, y Akemitsu no tiene deseos de convertirse en un tipo como ese. Pero cuando un encuentro fortuito con una joven lo deja con pensamientos demasiado impuros, decide hacer lo que debe: convertirse en monje budista y renunciar a las cosas mundanas. Pero el templo al que decide dedicarse... ¿está lleno de mujeres? ¿Y esa misma joven también está allí? ¿Qué puede hacer un chico en esa situación?
Los padres de Yukito son líderes de un culto. Después de ser sacrificado, reencarna en otro mundo donde no existe la religión y los libros pornográficos son considerados como dibujos infantiles. Descubre que es un mundo en el que la vida y la muerte están determinadas por el país. Mientras intenta impedir la ejecución de su amigo, ambos pierden la vida. Justo en ese momento, el dios de su religión llega a su mundo y los revive.
Después de perder a su hermana a los siete años, Satsuki Kakeru llevado una vida vacía, sólo pudo regresar a su día normal, con la ayuda de su amiga de la infancia Minase Yuka y otros amigos en la escuela. De repente, un día el cielo se vuelve rojo y la luna se vuelve negra. Todo el mundo alrededor de Kakeru y Yuka desaparecen y empiezan a aparecer monstruos en las calles. Ellos sólo son capaces de correr y esconderse y después de un tiempo, el mundo vuelve a la normalidad. Pero justo cuando pensaban que este mundo era un sueño, la red night se produce de nuevo…
La historia se centra en Ayase Yuko y Nogizaka Haruka. Yuto es bastante ordinario, mientras que Haruka es atractiva, inteligente y rica, lo que hace que otros estudiantes la sigan y admiren, tanto que hasta le ponen apodos franceses como “Nuit Étoile” [La Estrella Plateada De La Noche] y “Lumière du Clavier” [La Brillante Princesa en el Piano]. Un día, Yuko va a la librería de la escuela para devolver algo, cuando se topa accidentalmente con Haruka, descubriendo en el acto, el secreto más oscuro de ella: es una hardcore fan del anime y manga. Posterior a eso le promete guardar su secreto, y se vuelve en su consejero y confidente, por lo que empieza a salir más con ella, yendo a su casa constantemente y acompañándola a Akihabara.
Satou ha estado enamorado de su amiga de la infancia y vecina, Hime, desde que ella y su abuelo aparecieron de la nada hace 10 años. Ahora una deslumbrante y misteriosa belleza de secundaria, ella hace cada vez más difícil que él confiese sus sentimientos. A medida que se acerca el aniversario de su primer encuentro, ¿reunirá el valor necesario para transformar su amistad en algo más? ¿O les espera un destino completamente diferente a esta pareja tan unida?
