Procesando...La historia se desarrolla en la Academia Mihama, en un entorno completamente cerrado para que las chicas que en ella estudian puedan ser educadas y cultivadas sin influencia externa alguna. Cinco chicas pasan sus días entre los muros de la academia con aburrimiento y arrepentimiento. Yuji Kazami es un muchacho que acaba de unirse a la academia como el único estudiante masculino de la misma.
El Virus Asesino de Hombres: una enfermedad letal que ha erradicado al 99,9% de la población masculina del mundo. Mizuhara Reito ha estado en sueño criogénico durante los últimos cinco años, dejando atrás a Tachibana Erisa, la chica de sus sueños. Cuando Reito despierta de la congelación, emerge en un nuevo mundo enloquecido por el sexo donde él mismo es el recurso más preciado del planeta. A Reito y a otros cuatro sementales se les da una vida de lujo y una simple misión: ¡repoblar el mundo fecundando a tantas mujeres como sea posible! Sin embargo, lo único que quiere Reito es encontrar a su amada Erisa, que desapareció hace tres años. ¿Podrá Reito resistir la tentación y encontrar a su verdadero amor?
Hasegawa Kodaka cambia mucho de escuela y le cuesta mucho hacer amigos. Y no le ayuda su pelo rubio, la gente piensa que es un delincuente. Un día, acude a su compañero de clase y solitario Yozora mientras habla con su amiga imaginaria Tomo. Como ninguno de los dos tiene amigos, deciden formar un club y reclutar a gente. Así es como se formó "Rinjinbu", un club diseñado especialmente para gente que no tiene amigos. Mientras otros compañeros se unen al club, aprenderán como entablar una amistad mediante la cocina, los juegos y otras actividades de grupo.
Después de tener un amor no correspondido durante años, Naoya Mukai finalmente sale con su amiga de la infancia, Saki Saki. Sin embargo, justo cuando intenta comprometerse con esta relación, recibe una abrupta confesión de Nagisa Minase. Al principio, Naoya intenta rechazarla, pero pronto se ve abrumado por sentimientos de no querer lastimar a Nagisa. Tratando de evitar traicionar la confianza de su novia en él, Naoya piensa en una “solución” para hacer felices a ambas chicas: salir con ambas al mismo tiempo. Naturalmente, Saki rechaza esta idea, pero a través de la persistencia de Naoya y Nagisa, acepta a regañadientes. Con esto, comienza un romance a tres bandos entre Naoya, su novia y su “otra” novia, ya que desarrollan una relación que va en contra de la norma social.
Minato Sahashi es extremadamente inteligente, pero por su imposibilidad de aguantar la presión ha suspendido los exámenes de acceso a la universidad dos veces. Como resultado ha sido etiquetado de idiota y perdedor por mucha gente. Un día después de hablar con su madre, contacta con una chica que está en peligro, llamada Musubi. La chica sale corriendo, pero se lleva con ella a Minato, quien sin saberlo, es un Ashikabi, uno de los misteriosos maestros que tienen la particularidad de que pueden ser pareja de las 108 preciosas chicas llamadas “Sekirei”. Esto permite a las Sekirei utilizar todo su poder para ganar las competiciones organizadas por la compañía misteriosa MBI.
Haruka Kasugano y su hermana gemela Sora han perdido a sus dos padres en un accidente, y con ellos todo lo que tenían. Deciden mudarse de la ciudad al pueblo donde veraneaban con su abuelo. Al principio parecía familiar y pacífico, pero cambia cuando Haruka empieza a recordar cosas de su infancia.
