Procesando...Un alquimista fugitivo con habilidades misteriosas lleva a los hermanos Elric a un valle distante de barrios pobres habitados por los Milos, un pueblo orgulloso que lucha contra la explotación burocrática. Ed y Al se encuentran rápidamente en medio de una creciente rebelión, mientras los Milos exiliados arremetían contra sus opresores. En el corazón del conflicto está Julia, una joven alquimista que se hizo amiga de Alphonse. No se detendrá ante nada para restaurar a los Milos a su antigua gloria, incluso si eso significa aprovechar el terrible poder de la mítica Piedra Filosofal.
Asuna Yuuki, que sobresale tanto social como académicamente, va camino de superar sus exámenes de acceso al instituto. Su amiga y compañera de clase, Misumi "Mito" Tozawa, le aconseja que se tome un pequeño descanso de sus estudios y se una a ella el día del lanzamiento de Sword Art Online (SAO)—el esperado juego multijugador de realidad virtual online. Asuna acepta su oferta y pronto se encuentra con ella en el juego. En un cruel giro del destino, Asuna, Mito y todos los demás jugadores conectados a SAO se encuentran atrapados en el juego de forma permanente. La única forma de salir es superar los cien pisos del juego, y para empeorar las cosas, morir dentro del juego matará al jugador en la vida real. Con SAO convertido en una pesadilla de muerte, Asuna y otros jugadores —como el espadachín solitario Kazuto "Kirito" Kirigaya—deben adaptarse y sobrevivir, mientras intentan vencer a la implacable competencia para llegar a la cima.
Después de un accidente de avión durante un viaje escolar, Oribe Mutsumi y sus compañeros de clase quedaron varados en una isla aparentemente desierta. Mutsumi encontró a los otros sobrevivientes y usó sus conocimientos para ayudarlos. Estos esperan a ser rescatados al menos en tres días, lo que no parece ser mucho tiempo. Sin embargo, Mutsumi no tuvo en cuenta el hecho de que la isla está poblada por gigantescos insectos asesinos. Su conocimiento de mariposas, avispas y demás, puede ser lo único que le ayude a que alguno de sus compañeros de clase sobreviva antes de ser rescatados.
Cuando Hina-chan se enamora de Koyuki Ayase en la escuela, su falta de valor hace que él se gradúe y vaya a preparatoria sin saber sus sentimientos. Pero cuando llega el momento de escoger, Hina decide que irá a la preparatoria de su antiguo senpai para declararle su amor.
Satoshi encuentra al Pokémon singular Volcanion cuando este cae del cielo, y una misteriosa fuerza los obliga a permanecer unidos. Volcanion intenta huir, pero se ve obligado a llevar a Satoshi consigo en su misión. Los dos llegan a una ciudad de ruedas y engranajes donde un dirigente corrupto ha robado la invención definitiva: el Pokémon Artificial Magearna, creado 500 años atrás. ¡Y su intención no es otra que usar el misterioso poder de Magearna para hacerse con el control de ese reino mecánico! ¿Podrán Satoshi y Volcanion trabajar en equipo para rescatar a Magearna?
Rikka es la hija mayor de un clan de ninjas que vive en una residencia ninja situada en una ciudad futurista y que admira mucho a su padre, un investigador. Rikka lleva una vida tranquila hasta que de repente su hogar es atacado, y estando entre la espada y la pared, ¿cómo superará la crisis? ¡Acabando con la oscuridad!
Dotado de su pasión por el buceo y su admiración por la biología marina, el estudiante universitario Tsuneo Suzukawa se esfuerza por hacer malabarismos con varios trabajos a tiempo parcial para ganar el dinero suficiente para estudiar en el extranjero. Pero una noche, en un fatídico accidente, conoce a una chica en silla de ruedas, lo que hace que su camino actual se desvíe. La chica, Kumiko —que prefiere que la llamen "Josee"—, se muestra inicialmente grosera. Sin embargo, la abuela de Josee convence a Tsuneo para que acepte el trabajo remunerado de ser el cuidador de Josee. A pesar de estar molesto con su comportamiento mandón, Tsuneo ve la oportunidad de ahorrar más fondos para apoyar su sueño académico. Sin embargo, después de aguantar el comportamiento de Josee durante algún tiempo, Tsuneo intenta dejarlo, sólo para descubrir los sueños de Josee de viajar al mundo exterior, para experimentar una vida libre de su condición de lisiada. Al cambiar de opinión, Tsuneo decide acompañar a Josee en la exploración de las maravillas que ofrece el mundo. Durante el tiempo que pasan juntos, los dos empiezan a darse cuenta de que los rasgos que les unen pueden ser vitales para cumplir sus respectivas aspiraciones.
Takasugi y el Kihetai han regresado, ahora con un aliado que posee una espada demoníaca. Dependerá del Yorozuya evitar que Takasugi lleve a cabo su plan de arrasar con Edo dejando a un lado los sentimientos que tuvieron como compañeros de lucha en la guerra contra los Amanto. Durante la noche, el terrorista Kotaro Katsura es atacado por un espadachín asesino. El camarada de Katsura, Elizabeth, va al trío Yorozuya solicitándoles su ayuda en la búsqueda de Katsura. Mientras Shinpachi Shimura y Kagura van a buscar Katsura, Gintoki Sakata recibe una petición para encontrar al asesino por el espadero Murata Tetsuya para recuperar la espada mecánica Benizakura que ha sido tomada por un asesino en serie. Shinpachi y Elizabeth son emboscados por el asesino Nizo Okada que afirma haber matado a Katsura.
